Ci-dessous, le vocabulaire de base pour bien démarrer en R. Nous n’avons pas tout vu mais vous savez comment trouver de l’aide pas vrai ?
Environnement
<-, assign : assigne une valeur%>%/|> : forward pipe g(f(x)) devient x %>% f %>% gget/setwd : accède et changer l’emplacement de travailhere::here est une alternative plus génériquels : liste les objets dans l’environnementrm(list=ls()) : efface tous les objets mais votre ordinateur peut prendre feuobject.size : taille d’un objetinstall.packages/library : installe et charge des packagescitation : citer les gentils genssessionInfo : informations de session, notamment le versionnage
Arithmétique
+ |
addition |
- |
soustraction |
/ |
division |
* |
multiplication |
%% |
modulo |
%/% |
division euclidienne |
^ |
puissance |
Mathématiques
log |
logarithme (népérien) |
log10 |
logarithme (décimal) |
exp |
exponentielle |
sum |
somme |
min |
minimum |
max |
maximum |
range |
étendue, raccourci pour c(min(x), max(x)) |
median |
médiane |
quantile |
quantile (voir l’argument probs) |
summary |
un peu de tout ce qui précède |
round |
arrondi classique |
signif |
garde n chiffres |
floor |
arrondi inférieur |
ceiling |
arrondi supérieur |
var |
variance |
sd |
écart-type |
cor(x, y) |
corrélation |
cov(x, y) |
covariance |
cos et al. |
trigonométrie |
?Complex |
pour la gestion des complexes |
Valeurs spéciales
NA pour les valeurs manquantes. na.omit et les arguments na.rm aident à filtrer ces valeurs.NULL : ensemble vide-Inf/Inf : ±∞pi et autres constantes (?Constants), letters- Beaucoup de jeux de données disponibles nativement, voir
?datasets ## Arithmétique
Comparaison
< |
strictement inférieur |
<= |
inférieur ou égal |
> |
strictement supérieur |
>= |
supérieur ou égal |
== |
égal |
!= |
différent |
%in% |
dans l’ensemble |
Tests logiques
! |
NOT |
& |
AND (élément par élément) |
&& |
AND |
| |
OR (élément par élément) |
|| |
OR |
xor(x, y) |
OR (exclusif) |
all |
teste si uniquement des TRUE |
any |
teste si l’une des conditions au moins est TRUE |
Control flow
- Toute la clique habituelle (
?Control) : if, else, ifelse, for, while, next, break, etc.
Fonctions
nom_fonction <- function(arg1=default1, arg2=default2, ...) {
# instructions
return()
}
- Les arguments et leurs valeurs par défaut sont optionnels.
return n’est pas obligatoire, la dernière ligne est renvoyée. Ne rien retourner est possiblelist() pour des retours de plus d’une valeur- fonctions anonymes, souvent créées à la volée:
function(.x) .x*2 ou \.x .x+2. Souvent passé en formula à map (argument .f), par exemple : ~x+3
Vecteurs
[i]/[i]<- : accède et modifie les i-ème(s) position d’un vecteurc : concatène des valeurs et crée un vecteurnames/names<- : accède et change les noms d’un vecteursort : ordonne un vecteurorder : ordonne un vecteur mais retourne les indicesrev : retourne un vecteur du dernier au premier élémentunique : retourne les valeurs distinctestable : compte les valeurs d’un ou de plusieurs vecteurs
Séquences régulières et aléatoires
seq : séquences régulièresa:b : raccourci pour seq(a, b)rep : répète un vecteur ou ses élémentsrunif/rnorm/rbinom : nombres aléatoires issus d’une distribution uniforme, normale, binomiale. Voir ?Distributions
Matrices
[i, j] + [i, j]<- : accède et modifie les valeurs aux i-ième(s) et j-ième(s) indices (lignes puis colonnes)matrix/data.frame : créationis/as.matrix et is/as.data.frame : test et conversion de typecol/rownames et col/rownames<- : accéder et définir row/colnamest : transposition%*% : multiplication matricielle (matrix only)apply : opération marginalerow/colSums : raccourci pour apply(m, 1/2, sum)
dplyr : Manipulation de data.frame
- RStudio :
Help > Cheatsheets > dplyr : très bonne adresse
vignette(package="dplyr"), par ex. vignette("dplyr")- on préférera les tibbles qui apportent des améliorations cosmétiques aux data.frame (
as_tibble)
tibble et tribble pour le constructeurslice : filtre sur les lignes avec des indicesfilter : filtre sur les lignes avec des tests logiquesselect : sélectionner et réordonne les colonnesstarts_with et autres helpers de tidyselectrename : renomme les colonnesmutate : crée de nouvelles colonnesgroup_by/ungroup : groupe, déproupe par colonnessummarise : résume en 1 ligne ou 1 ligne par groupe, des colonnesgroup_split : tranche une tibble par groupebind_rows/cols : colle par lignes ou colonnes*_join : opérations de join sur deux tables partageant un index
stringr : manipulation de chaines de caractères
vignette(package="stringr"), par ex. vignette("stringr")
ggplot2 : un grammaire pour les graphes
vignette(package="ggplot2"), par ex. vignette("ggplot2")- RStudio :
Help > Cheatsheets > ggplot2 : très bonne adresse
forcats : manipulation de facteurs
vignette(package="forcats"), par ex. vignette("forcats")
purrr : travailler avec des listes
vignette(package="purrr"), par ex. vignette("purrr")- RStudio :
Help > Cheatsheets > purrr : très bonne adresse
map(liste, function) : travaille sur une liste, retourne une listemap(liste, ~.x %>% ...) : accepte les fonctions anonymesmap_{dbl, chr, lgl, df, dfr, dfc} : idem mais retourne des numeric, character, logical, data.frame, data.frame collés par lignes/colonnesmap2_*(liste1, liste2, ...) : idem pour deux listespmap_* : généralisation à N listes
Import/Export
- texte brut :
readLines
- lire des tables :
read.table, readr::read_csv, xlsx::read.xlsx.
Import dataset dans RStudio est moins pénible de prime abord- écrire des tables :
write.table, readr::write_csv, xlsx::write.xlsx
save/load : sauve et charge un objet R/.rda- pour les plots de
graphics : pdf(...) {...} dev.off()
- pour les ggplot de
ggplot2 : ggsave
Interactions audio-visuelles
- bips : package
beepr
- barres de progression : package
progress
- invite de commande :
readline
- logs :
sink
Sys.sleep, Sys.time, Sys.* : pause, horodatage, autres interactions
❤ Placé dans le domaine public par Vincent Bonhomme